| Formula | Ion | Calcd Mass | Found Mass | Recalcd Mass | Dev(Calcd) (ppm) | Dev(Recalcd) (ppm) | Error |
|---|
错误描述：纯文本“Error”，无额外说明。
根本原因：
molmass.Formula 解析，如包含非法字符（例 C12H-O）、元素顺序混乱等。Calcd Mass（理论质量）或计算出的 Recalcd Mass（校准后质量）不是有效浮点数，如包含字母（例 300.123a）、缺失小数点等。错误描述：“未找到分子式”，即 No formula found。
根本原因：
PDF文本中该HRMS条目仅包含离子类型（Ion）和质量数据（Calcd Mass、Found Mass），但未包含可被正则 r'C\d+(?:H\d+|F\d+)(?:[A-Z][a-z]?\d*|\[\d+[A-Z][a-z]*\d*])*[+-]?' 匹配的分子式，可能因文本缺失分子式或分子式格式超出匹配范围。
错误描述：
Typo (Calcd,Found)：理论质量与实测质量存在单个字符差异（排除最后两位）。Typo (Calcd,Recalcd)：理论质量与校准后质量存在单个字符差异（排除最后两位）。根本原因：
PDF文本中质量数据存在输入错误（如人工录入时多输/少输一个数字）或OCR识别错误（如将 3 识别为 5），导致质量数据仅单个字符偏差（例 300.1234 vs 300.1254）。
错误描述：
Transposed digits (Calcd,Found)：理论质量与实测质量存在相邻数字颠倒。Transposed digits (Calcd,Recalcd)：理论质量与校准后质量存在相邻数字颠倒。根本原因：
PDF文本中质量数据存在“相邻数字颠倒”的输入错误（如将 1234 写成 1324）或OCR识别时将相邻数字混淆（如 2 和 3 位置颠倒），导致质量数据仅相邻数字偏差（例 300.1234 vs 300.1324）。
错误描述：“质量是按阳离子计算的，实际为阴离子”，即 Mass was calculated for cation。
根本原因：
计算 Recalcd Mass（校准后质量）时，代码默认按阳离子（电荷为正）处理，但实际离子为阴离子（如 ion_charge == "-" 或离子类型含 M-，例 [M-H]-），导致质量偏差约一个电子质量（阴离子需加电子质量，阳离子需减电子质量，电荷判断错误引发偏差）。
错误描述：
Molecular weight error：理论质量等于“带电荷分子式的分子量”（未除以电荷数）。Molecular weight error (neutral)：理论质量等于“中性分子式的分子量”（未加/减电荷对应的质量）。Molecular weight error (neutral+1)：理论质量等于“中性分子式分子量+1”（可能误加 13C 同位素质量）。Molecular weight error (neutral+23)：理论质量等于“中性分子式分子量+23”（可能误加钠元素质量 22.98977）。Molecular weight error (Formula+Na)：理论质量等于“原分子式加钠的分子量”（可能误将钠离子峰按分子峰计算）。根本原因：
PDF中的 Calcd Mass（理论质量）计算逻辑与代码预期不符：代码预期理论质量是“离子的精确质量”（需除以电荷数，例 [M+Na]+ 需用分子质量+钠质量后除以1），但实际PDF中的理论质量是“分子的分子量”（未处理电荷或额外元素，例直接用分子质量作为 [M+Na]+ 的理论质量）。
错误描述：
Add X Y to formula：需给分子式添加 X 个 Y 元素（例 Add 1 H-atom to formula）。Remove X Y from formula：需从分子式移除 X 个 Y 元素（例 Remove 2 O-atoms from formula）。根本原因：
PDF中提取的分子式与实际离子的分子式存在“元素数量差异”：
[M+H]+，但提取的分子式为 C12H24O（少1个H），导致校准质量偏小，误差为正，提示添加元素。[M-O]+，但提取的分子式为 C12H24O2（多1个O），导致校准质量偏大，误差为负，提示移除元素。错误描述：以 +/- 开头的浮点数（保留4位小数），例 +0.0052、-0.0031。
根本原因：
误差来源不属于上述任何已知类型，可能原因包括：
error_dictionary 未包含该偏差对应的元素或特殊情况（例未添加某元素的同位素质量）。